F. necrophorum 1_1_36S_FusoPortal_Gene_1461

InterPro predicted function:
InterPro Accessions:

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FASTA file of all annotated F. necrophorum 1_1_36S genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. necrophorum 1_1_36S genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 1_1_36S_FusoPortal_Gene_1461.out

Amino Acids: 1789

ORF FASTA file - Amino Acids

MILSVEKQNERFVAIISDCLVVDSCIVKNSWNSHIQNVDLKQNLFAHDWNLYEDNDLSIF SFPLEKITDVQNFYEIIVESNGLTYSFFVDYTYFVDYRYEPHIYYYNIPDNMKPLDLDTS KYSFYIVGNYTDKYKVKIEEIKNNRFITFKIPDKNLLESEFYYFEITERVAGDEKRFLKD TIGIETKKGAQFLYSLEDYGRYYKCDVFSKYPYKFLKEVKVNGNLVPVESNIIGEKYSKH KITLFLTKSDYTKDIELFIEYKVQEDYLGAIIIDKNTLLTFENKEKKEYKITNFETYYDF KHDTMYLTWQNSFPNVIRYKLILYAEDQRYVGDYSDGTSVFYTKEQVFKISEFVNFNQQQ DFLKLEIHASVNNVYIPLMQDISFDNPFVKFKSSPCEVVIENEDFLKTDKLSGFITWSGA KFPHYSKIKIEADFIHQFLNEFTEPWKTEEDLILHKTVADFSKAYPNLEDEIEYDFTEKG VLRGKPKDAFCSFLGLEQDFVRIEEDRYLVPKWYTKKNSPYRITVQIYDLWDRLCGENTI SFTNEVKSIPFQTKNLIVKRGQEIQFGEKGTIGEFYLKQNPTPYETQLAYSKEFVTYLDL PLFDESNVDEEQNSLYYYFSNAEIYKNIPIVLNFQRKSNFYSLDYELFFDEKSKLKGTFK IKGNDAKENKIVIPRHVFQEEGVYTMQFQTSNFANNKSTTSSMKFFVYNTKPETPVVSIP SQDLYIGKEKMTVNKKYFRIEVTNNGKSKSYAGWKYKEVHFFFKNKFGTSVYNSFPDYVV QANKTDGKILLRNTVSIENSEYDCKVIAYDYSGNASDPYEFSFEVISEISIEPEKLFTNE LEKTDFIWTIQKSEDSDGFYYFLSYSSDGVTYDETETPIKVDSKYYLSDSNTKRKYELKL SWLKNNLENVKVGFYKLVCYEWSYKHPNGLSNYKFYSKPVEVNKIGNASEPIFAKNLEGT VRVFNQKQENEYAYTSDMDKIVFTTIHNESTLDDGSEKPDEQIVGQFYKIKLLEPGTSNE YQCRLPIPTKIGEYSFTEIAKKCNIHDQKEGVWELRFITRDRLGNINEKNGYYTYYIVVT KRSPVINSIVHANGTGSEYFGLNASEIAFDINETTYQDIENYHEHRDKFKFDKVIVNYLS NPQNVLQKMEIPIFRKTDIISVKVRDNLTEVNKKQHDLDGRYILTFQLVDPLGRKSELIE KTYYISTKISYDLLFLTQERFITNNVKIVASISNNVKNIYYKFVEEYEIDELKKADYKTF TQFPVQKLEYDTKQIYGFETEEKTFESNGNKYLCYFVEEKSGNVSSLQTYKFMVDTTAQF IPIFDSTNKVYYTPRDNMVTITWNNTHKDVTQFYAKLNKIKLENGEYVIEKEYRINVLDK EILLEVSQEQNAFIDIKDRRFFNFLLQDGGIFESGHYMLTIKGVSKYGTSLENNFKFQIN KASIILGEIKKTTITVENNIITWTDLDSAEHYEISYDGKNFASTKFNFFVIDPNQLVEDK NNGKKYLYLRYKTYHDVFSTTTRVEITVDIKRLQKPEIIKDVSVITDTSFDGWNVIVKDP LDAKYIYYSFDNKNWQTQEVSGTTNKIIKDGVKPFPDGIYDIFLYTTDRLVTSEIPYNKS ETVHSFVEVFAEPIPIPTLNIKNTEMINFPKNLYILDKLPNVDYYIFVNKRKVNEGFELS SGNQSIFKIDVKAIKKGTKELVNLITDFEVTVYTPNTYIIRINDEELLCNVNAKANVLEI IQMPNKKDNQVIMYKEKDNFLENWQVVHINDTLSLEKEWEFKIVTFHIV

Coding DNA - Genome Coordinates: 1499951-1505320 | Orientation: Forward

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGATATTATCTGTAGAGAAGCAAAATGAACGTTTCGTCGCTATCATATCTGATTGTTTAGTTGTGGATT CCTGCATTGTAAAAAACTCTTGGAATTCACATATTCAAAATGTTGATTTAAAACAAAACCTATTTGCGCA CGATTGGAATTTGTACGAAGATAACGATTTATCTATTTTTTCTTTCCCTCTTGAAAAAATTACTGACGTT CAAAATTTTTATGAAATTATCGTAGAGTCAAACGGCTTAACTTATTCTTTCTTCGTCGATTATACATATT TTGTGGATTATAGATATGAACCCCATATATATTACTATAATATCCCTGATAATATGAAACCGTTAGATTT GGATACTTCTAAATATTCCTTTTACATTGTAGGTAATTATACTGATAAATACAAAGTTAAAATAGAAGAA ATTAAAAATAATCGTTTTATTACATTTAAGATCCCGGATAAGAATTTGTTAGAAAGTGAATTTTATTATT TCGAAATTACAGAACGCGTCGCCGGCGACGAAAAAAGGTTTTTGAAGGATACTATCGGTATTGAAACTAA AAAAGGTGCTCAATTTTTATATTCATTAGAGGATTACGGACGGTATTATAAATGTGATGTTTTCAGTAAA TATCCTTATAAATTTTTAAAAGAAGTTAAAGTGAATGGAAATTTAGTTCCTGTGGAAAGCAATATAATCG GTGAAAAATATTCAAAACATAAAATTACTTTATTTTTAACAAAAAGTGATTATACGAAAGATATAGAATT ATTTATAGAATATAAAGTACAAGAAGATTATCTTGGTGCCATAATTATAGATAAAAATACATTATTAACA TTTGAAAATAAAGAAAAAAAAGAATATAAAATTACCAATTTTGAAACTTATTATGACTTTAAACACGATA CAATGTATTTAACTTGGCAAAATTCCTTCCCTAATGTTATTCGTTATAAACTTATATTGTATGCGGAAGA 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ACAAACCTATAAATTTATGGTAGATACTACCGCTCAATTTATTCCTATTTTTGATTCCACTAATAAAGTT TATTACACCCCAAGAGATAACATGGTAACAATTACTTGGAATAACACGCATAAAGATGTTACACAATTTT ATGCTAAATTAAATAAAATAAAGCTGGAAAACGGAGAATATGTAATAGAAAAAGAATATCGAATTAACGT TTTAGACAAAGAAATCTTACTAGAGGTTAGTCAAGAGCAAAACGCTTTTATTGATATAAAAGATAGAAGA TTTTTTAATTTCCTATTACAAGATGGTGGGATTTTCGAAAGCGGACATTATATGTTAACTATCAAGGGTG TTTCTAAATATGGAACATCTTTAGAAAACAATTTTAAATTTCAGATCAATAAAGCTTCCATTATACTTGG TGAAATTAAAAAAACTACCATTACGGTAGAAAACAATATCATCACTTGGACCGATTTAGATAGTGCTGAA CATTATGAAATTTCATACGATGGAAAAAATTTCGCTTCTACTAAATTCAATTTCTTTGTAATAGATCCGA ATCAATTAGTAGAAGATAAAAATAATGGAAAAAAATATTTATATCTACGTTATAAAACGTATCATGATGT TTTTTCCACTACTACGAGAGTCGAAATTACAGTTGATATCAAAAGATTGCAAAAACCTGAAATTATAAAA GATGTTTCAGTGATTACCGATACTTCTTTTGATGGATGGAACGTGATCGTAAAAGATCCTTTAGATGCGA AATATATTTATTATTCTTTTGATAATAAAAATTGGCAAACACAAGAAGTTAGCGGAACTACAAATAAAAT CATCAAAGATGGCGTGAAACCTTTTCCTGATGGAATCTACGATATTTTTCTATATACAACCGATAGATTA GTAACTTCTGAAATTCCTTATAACAAATCTGAAACTGTTCATTCATTTGTGGAAGTATTTGCAGAGCCAA 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