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Hidden Markov Model (HMMScan) for domains:
1_1_36S_FusoPortal_Gene_2005.out
Amino Acids: 544
ORF FASTA file - Amino Acids
MYFQVLCTVVGGLGIFLLGMENMSSGMQKIAGPRLKKILATLTTNRVLGIFTGILITALV
QSSSVSTVMTIGFVNASLLTLKQALGIILGANIGTTITGWLLAMNIGKYGLPIVGVAAIL
LMFKKEDKIKVRLRTLMGFGFIFLGLQLMSDGLRPLRDLPEFVNMFQAFQANSYLGVLKV
ALVGAAITGIVQSSAATLGITITLASQGLIDYPTAVALVLGENVGTTITALLASLGASSN
AKRAAYAHTLINLIGVLWVTAIFPYYLFALENILDPMHHMGAAIASAHTFFNICNVILLI
PFIGMFDTFLQKVVSSDENMEEGEMKVTKLSAMGKMLPTVIIDQTKNEVLTMGKYIKHIF
FRLEELYEDSEKIPVNVAEINEVEDKLDLYEKEINNVNYALLNRTLNQEYIEKTRRNLLV
CDEYETISDYIGRIGDSIEKLQEHNILIEGFRVEILKDLNDKLVQFFQHIHHGYESKEMK
YFSEGIDEYNEIKNFCKMKRKEHFKDNTENIIPSRLNTEFSDIINYYQRAADHIYNIIEF
YMKL
Coding DNA - Genome Coordinates: 2159586-2157952 | Orientation: Reverse
ORF FASTA file - Coding DNA
ATGTATTTTCAGGTATTATGTACCGTTGTAGGAGGACTGGGAATTTTTTTGTTGGGAATGGAGAATATGT
CCTCCGGAATGCAGAAAATTGCAGGACCACGTTTGAAAAAGATTTTGGCAACCTTAACGACCAATCGGGT
ATTGGGAATTTTTACAGGGATTCTCATAACCGCTTTGGTACAATCTTCTTCGGTGAGTACCGTGATGACG
ATTGGATTTGTCAATGCATCTTTGTTGACCTTAAAACAAGCCTTAGGAATTATTTTAGGAGCGAATATCG
GGACTACCATTACAGGTTGGTTGCTTGCCATGAATATTGGAAAATACGGTTTGCCGATTGTGGGAGTCGC
CGCCATACTCTTAATGTTTAAAAAGGAAGATAAGATCAAAGTTCGTTTACGAACTTTAATGGGCTTCGGA
TTTATTTTTTTGGGATTACAGCTCATGAGTGACGGGCTGCGACCTTTACGGGACTTACCGGAATTTGTGA
ACATGTTTCAAGCCTTTCAAGCCAATTCCTATTTGGGAGTGTTAAAAGTGGCTTTGGTGGGAGCCGCTAT
TACCGGAATTGTGCAATCTTCTGCCGCTACTTTAGGAATTACTATTACTTTGGCAAGTCAAGGATTGATT
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CGCTTGGAGCTTCTTCCAATGCAAAACGGGCAGCCTATGCTCATACTTTAATCAATCTTATCGGAGTGCT
ATGGGTCACTGCTATTTTCCCTTACTATTTATTTGCTTTGGAGAATATCTTGGATCCGATGCATCATATG
GGAGCGGCGATTGCTTCCGCTCATACTTTTTTCAATATTTGTAATGTCATCTTATTAATTCCCTTTATAG
GTATGTTTGATACATTCTTACAAAAAGTAGTATCAAGTGATGAAAACATGGAAGAAGGGGAAATGAAGGT
TACCAAGCTTTCCGCCATGGGAAAAATGTTGCCTACCGTAATTATTGATCAAACCAAGAACGAAGTACTG
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CTGTAAATGTGGCAGAAATCAATGAAGTGGAAGACAAATTGGACTTGTATGAAAAGGAAATCAATAATGT
AAACTATGCTCTTTTGAATCGAACTTTAAATCAGGAATATATTGAAAAAACAAGAAGAAATTTATTGGTT
TGCGATGAATATGAAACCATCAGTGACTATATCGGAAGAATTGGGGATTCCATTGAAAAATTACAGGAAC
ATAACATCCTGATTGAGGGCTTTCGAGTAGAAATTTTAAAGGACTTAAATGATAAACTCGTGCAATTTTT
TCAACACATTCATCATGGATATGAAAGCAAGGAAATGAAATATTTTTCAGAGGGTATTGACGAATACAAT
GAAATTAAGAATTTCTGTAAGATGAAGCGAAAGGAACACTTCAAGGATAATACGGAAAATATCATTCCTT
CCAGATTGAATACGGAGTTCTCGGATATTATCAACTATTATCAGAGAGCTGCAGACCATATTTATAATAT
TATCGAGTTTTATATGAAATTGTAG
