F. nucleatum 25586_FusoPortal_Gene_58

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

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FASTA file of all annotated F. nucleatum 25586 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. nucleatum 25586 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 25586_FusoPortal_Gene_58.out

Amino Acids: 2361

ORF FASTA file - Amino Acids

MSNNLYKVEKNLRSIAKRYKSIKYSVGLAILFLMLGVGAFSEEVNDTQVNNVPTREEIAS SRENLKNSVGSLQSKINQARAENSKGLEGLRLELIQLMEQGDQVVKSPWMSWQFGANYMY SKWNGTYKGKGDKAEKYPFEGTFTRSTNLFERAVSPLSEKYKELATSTNPYSASSNARNG LGLGYGLASTTPRQEPLVAINIEASIRPKDVTRSAVSAPTVGVGAPRLDTLNVPSSEPLS VTPPDPKAPEKTVSIVQPNASPFTGFFFDADHNAIKFETSGNPDKDLSDVDLYSGLGYNS WANGNTNPQGAAKTGYIKGGTHTDVTNLHSVNVNDGDSGNIVGRTTNIIYRRGANNGNPV KLSNLNIYVRGYYDGTLSSGEGTTGKQDTWTDSGRGAAGGSADPGIPTRGTIGLHTLLNA KVSKVKANLYGRAGFLTSETWRSGTVTMENTTVNVYNDQNTAFYIMPAAYGTIAAYLSKG GSHDNFYIGGLKGSTNVNLYGTGNSVYLSTGISGARHIENEGIINSDGASNIVYSNIGYT PDWSKTWYQTRGNTINRALQNGYTKNIMRSVIKLGTGGGQVNLYGDENVGLFFGSKMGGA DPKSWEKEHRDAEFNPTSPGATKYLRKASFIGIYQGEIELHAKIGEKTSSTGKDQVNGVG NIHENTPNGKKYDPKFVEGAVGIYSESGQREGIDPIRDLGVPVNATGSRPSITNNYKYIG SLSKDTIHNLQVGKVDVKFGSKSKNGFMFISKLGTVMDIAKPGTATDYISGLSTEITDGM NGENTTEEDASTGTTIAYAEGTWDQGKHQLGSTEQYLKDNNNKANGSTAAKLQGLGSKIN IFTPKVTLASKEGIAYMGDNKGIINVGTTANKVKTTAVNHKSIIGFARDEGTVTINGNVE AKDAKAKTNKWQNIAGLAVKTKTGTKGGTVTINGDVDIHGMAGFADGTGSKVDLKGTGNK VSTGTDGALVAKNGGVINFGGGTITHKNNGTVAGKNDHESSVPFYADNNSKINFEGDGTN PSRTTIEMADGVLMSEEATAYNGLNDGKAKYNGMKNVTVKLIGDNVILKTSIGKDITWTG ASGLVASLKSDMKLGGLDLGTHKYKVYYLNGTFKIDTNIDLDDSKIAFHNVGLSNEMVTI NTGREIKSATGKGLAVASNKNATTNASSGYINKGNINITGGSLASGTIGLNVSYGTVRNE KNINVANGIGVYGINGSKLVNETSGKINIGTQGVGMAGFASAGARKNYGTDKLNSSSPFF NTEKLFEIENNGTIQANGDKSIGLYGETNDLYGRGLTSSNGSITNNGKLILTGNKAVGIV SKRATVKLNGTGSSDIVLGKEGIGVYAENSLVNLNSNYGIEVKDKGTGVYVDKDSEIITP GRTVELKYTGSNTGTGVGLFYEGKTAAIMTNGTNVKLIDTVGTTGGLVGLYTNNGGILTN NGNISGDKGYGIITDGTEINNAGNITFNNPVTSKNASVGIYTKSSDKITNSLIGKIKLGK NSVGIYGKAVENSGEIEVGDGGTGIYSGGGNVNLNSTGKINVGRDKAVAIYAKGTNQNIT AHSGSTINLGNTSFGIINEGTNNKITSNIANINNLGNDTVYIYSTDTRGRVTNNTNLKST GYLNYGIYSAGTVENKGNIDFSSGYGNVGIYSIKGGNANNTGNITVGKTMEISTPTASDP TKTTTYYAIGMAAGYTPESGTGYTGNITNAGTINVNGDGGSIGMYGTESGTRVINNGTIN LRANNSVGMYLDNGAYGENNGTIQTIGSGLKKVTGVVIKNGSRFKNNGTVKLDAESAIGL LTKGNSAGVNPGIIENYGTLDISGVGSQRTQESSGTDPLEKEMGGVAIKTPKNSSTSQIT VNGKVVKPTVVETSAKEYQDMSLSTIGMYINTSGTKFTRPITGLSALKQLKRADLIIGVE AAQNTTSKTIQVGQKILEPYNKTIKDNPQIEKWSIYSGSLTWMANIAQNQTDGTIQNAYL AKIPYTHWAGNESIPVDKKDTYNFLDGLEQRYGVEGIGTRENGVFQKLNGIGKNEQILFF QAIDEMMGHQYANVQQRVQSTGIILDKEFNYLRDEWRTASKDSNKVKVFGTNGEYKTDTA GVIDYKNHAYGVAYVHENEDIKLGRGTGWYTGIVHNTFKFKDIGKSKEHMLQAKVGLLKS VPFDDNNSLNWTISGDIFVGRNRMHRKYLVVDEIFNAKARYYTYGIGVKNEIGKEFRLSE SFTLRPYAALKLEYGRVSKIREKSGEIKLEVKQNQYFSVRPEIGAELGFKHYFGMKALKT TLGVAYENELGRVANGKNKARVVDTSADWFNIRGEKEDRRGNVKFDLNVGIDNTRVGVTA NVGYDTKGENLRGGLGLRVIF

Coding DNA - Genome Coordinates: 75894-68809 | Orientation: Reverse

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGAGTAATAATCTATACAAAGTAGAAAAAAACTTACGTTCAATTGCAAAAAGGTATAAGTCAATTAAGT ATTCAGTTGGCTTAGCAATTTTGTTTTTAATGTTAGGAGTAGGAGCATTTTCTGAAGAGGTAAATGATAC ACAAGTAAATAATGTACCAACAAGAGAAGAAATAGCTTCATCAAGAGAAAATTTAAAGAATTCAGTGGGA AGCTTGCAATCTAAAATTAATCAAGCAAGAGCAGAAAATTCAAAAGGCTTGGAAGGATTAAGATTAGAAT TAATTCAATTAATGGAACAAGGAGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAGCTAA CTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATAAGGCAGAAAAATATCCATTTGAA GGTACGTTTACAAGAAGTACAAATCTTTTTGAAAGAGCTGTTTCTCCTTTAAGTGAAAAATACAAGGAGC TAGCTACTTCAACAAATCCTTATTCAGCTTCTTCAAACGCTAGAAATGGATTAGGTTTAGGATATGGATT AGCAAGTACAACTCCAAGACAAGAACCTTTAGTAGCAATTAATATTGAAGCATCAATAAGACCAAAAGAT GTTACAAGAAGTGCAGTGAGTGCACCTACTGTTGGTGTAGGAGCACCTAGATTAGATACATTAAATGTTC CTAGTTCAGAGCCACTGTCAGTAACACCACCTGATCCAAAAGCACCAGAAAAAACAGTGAGTATTGTACA ACCAAATGCAAGTCCATTTACTGGTTTCTTTTTTGATGCTGATCACAATGCAATAAAATTCGAAACAAGT GGAAACCCTGATAAAGATTTATCAGATGTTGATTTGTATTCAGGATTAGGATATAATTCTTGGGCAAATG GAAATACTAATCCTCAAGGAGCAGCTAAGACAGGTTATATAAAAGGTGGTACTCATACAGATGTTACAAA 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