F. nucleatum 25586_FusoPortal_Gene_938

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

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FASTA file of all annotated F. nucleatum 25586 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. nucleatum 25586 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 25586_FusoPortal_Gene_938.out

Amino Acids: 2214

ORF FASTA file - Amino Acids

MKNNLEQIERHLRSIAKRYKSVKYSLSLVIVFLMVGINVFSEELMTQEAVSRESIQNSVG NLQTKINDLKSQNDKQLEGLRLELIQLMEQGNQVIKSPWSSWQFGINYMYSKWNGAYKGR GDKKNWPKDLREYFTDPLKRFVKNDSVTSSTYGLTTLNILYEPPAEITVSAGIRPKNVNK KESKFEPKEPAGALPTFEPRLIGTPGKPVAPATPSVNVFDTPDIPANGQSFAQRPIIGKR TADEYDNQISPRFNNAVVAQNYDEYTPEPDTPNGNIDVNMGETTTWGGGKIRLKSTVPEG RPFENGATETKDVNGAPRTMPKDPFISKPSGTYYLNPGKVETRDVWDIEGKKKDTVNAFI SDSRDHDTTINGNYTVKNLGSGPTTKLFFSYNPSGVGGKKYDNKASWGWSDGTEQAVNRV AKFTGNLTLKGVEDPNNKTALVGLEHQLWAKSKTSTHKDDKDEWNNSNSNSTLLNTGNIT LASGNYLVGMMIDVEYSNDKNHKNHKTINKGTININSKNSVGIDFAKYELGLLQTDVSLG NINVNGSNNYGFRMAKLFDGETKTYQGADNGSNLTVDGNKYYDNTTITGEGGKIVVGGKE NVGVSISKGVSADKSANPISNIKSLNIEVVGENVVGFLRNKDFSINNTGNIVLDDTTVQS LTFGNGAKNSTLVRSDNGTIDIKKNLNATKGSTGNSFSQATSGGRVVNHSILKSTLSHFT GMISYGRGNLRSSTAINKGTIELTGDSDSNIGMAALNSGEIRNENGTIKVLGKGKNKAAI YTDQTSSATLNGGNYFISGESSSGIYNQGSTILGDNNKIFASNGAVGIYSSGGTIDGSHA ANGVDIEVDDGDSEEKGLAVYGENGTDIKLQNSKINVKKGIAGVAAFGANTKINLNGATL KYSGSGYAAYATGGGKIDLSNSRIELRGRATGFEMAGSGTSPITLNSNTRIHVYSNDVTV MNIKDMASLNYSNLNSTAFNSYLQGATVHAENGATDYKLAAVDGIGAYNINSSLDKKLAV NPANKNTNDYIFTRLLSVQRARMNLKSGNNVRAVLSSSELAAIKEKTVVGLAMNSSKNAV SNTETAINLENNTTVTADRTDAGDGAVGLFVNYGTVNVASGATINVEKENNVVNEKAVGI YAVNGTEVDNKGTINVGGKNSIGIFGIAYRTDNAGNKKIDEFGSNAVGQGKVNIKNQGTL SLNGEGASGILVKNNKGTAASLGEHKALNTGTINMSGNKAIGMFAEKGYLKNEGTINITG SQQGIGMYGHLGSILENGTNGKINVADSNDENKLNIGMFTDDINTKIMNAGKISVGKNSY GIYGKNITTTATSKIKTGDNGVGIFSSTKDSNTTLDLAPGSEITVGNNNAVGVFSLGNKA AHITSFSKMNIGNGSFGYVIRSKGSTLNSNYAGETELKQDGTYIYSTDEDGTITNKTKLK SSGNKNYGIYASGNVKNLADINFATGYGNVGLYSTSNNSNKGITNGEAGSSGIKPKITVG ASKIRDTNGNLLKEKDRLYSIGMAAGYSWTEEDLKKPEAQRPKQFIGRIVNYGTISVTGD DGIGMYAVGRGSRAINHGLIDLSGKNSIGMYLDQGAIGENYGTIRTAPNNTKDGIIGVVA LNGSVIKNYGTISISGAGNTGIYKAQGGNNEGKKPEVSNGATDISSKATADTSKKLGTSQ ILSPPGATNAVIKEKGKVLTPDYVDRPTPNAPNVRAGSTILNLKQLQKFNGNSRARASEL GMYIDTSGIKFTKPIEGLEKLTNLKRINLIFGVEATKYSNNTAIQIGSNILEPYNKVIEK LSRSGSGKKWILNSSSLTWMATATQNPSNGTLGNVYMKKIPYTTFAVKGDTDTYNFLDGL EQRYGVEGLNSREKELFNKLNDIGKGEAQLFVQAVDEMKGHQYANTQQRVYATGQILDTE FNYLREEWATASKDSNKIKAFGARGEYKTNTAGVIDYKNYAYGVAYIHENESVKLGKDIG WYTGFVHNTFRFEDIGKSKEEMLLGKIGMFKSIPFDDDNSLNWTVSGNVFVGRNKMHRKF LIVDEIFNAKSKYYAYGIGVKNEIGKEFRLSEDFSIRPYGALKLEYGRISKIKEKTGEIR LEVKSNDYVSIKPEIGTELKYKYLFTNRKTLTVGLGVAYENELGKVANPKNKARVAYTAA DWYNLRGEKEDRRGNIKTDLTIGLENTRFGATANVGYDTKGHNVRTGLGLRVIF

Coding DNA - Genome Coordinates: 1020007-1026651 | Orientation: Forward

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGAAAAACAACTTAGAACAAATTGAAAGACATTTACGATCAATAGCAAAAAGGTATAAAAGTGTGAAAT ATTCACTCAGTTTAGTAATAGTTTTCTTAATGGTGGGAATAAATGTATTTTCAGAAGAGCTTATGACACA AGAAGCAGTATCAAGAGAAAGTATACAAAATTCTGTAGGTAATCTTCAAACAAAGATAAATGATTTAAAA AGTCAGAATGATAAGCAATTAGAAGGTTTGAGATTAGAATTAATTCAATTAATGGAACAAGGAAACCAAG TTATAAAATCACCATGGAGTTCATGGCAATTTGGAATAAATTATATGTATAGTAAATGGAATGGAGCATA TAAAGGAAGAGGAGATAAAAAAAATTGGCCAAAAGATTTAAGAGAATATTTTACTGATCCTTTAAAAAGA TTTGTAAAAAATGATTCTGTTACATCTTCTACTTATGGTCTAACAACACTAAATATCTTATATGAACCAC CAGCAGAAATTACAGTAAGTGCTGGGATAAGACCTAAAAATGTTAATAAAAAAGAAAGTAAATTTGAACC AAAAGAACCAGCTGGTGCTCTTCCAACTTTTGAGCCAAGGTTAATAGGTACTCCTGGAAAACCAGTAGCA CCAGCAACTCCTTCTGTGAATGTATTTGATACACCAGATATACCAGCAAATGGACAATCTTTTGCTCAAA GACCAATAATTGGAAAAAGAACAGCAGATGAATATGATAATCAAATAAGTCCTAGATTTAATAATGCTGT TGTAGCTCAAAACTATGATGAATATACACCTGAACCAGACACTCCTAATGGTAATATTGATGTTAATATG GGAGAAACTACTACTTGGGGTGGTGGAAAAATAAGATTAAAAAGTACAGTTCCAGAAGGAAGACCTTTTG AAAATGGAGCAACAGAAACAAAAGATGTAAATGGAGCCCCTAGAACAATGCCAAAAGATCCTTTTATATC 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