F. periodonticum 2_1_31_FusoPortal_Gene_1098

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

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FASTA file of all annotated F. periodonticum 2_1_31 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. periodonticum 2_1_31 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 2_1_31_FusoPortal_Gene_1098.out

Amino Acids: 2116

ORF FASTA file - Amino Acids

MRNNNLHDVEKNLRSIAKRYENVKYSVGLAVLFLMKGTNAFSDNNMIQEAEKQKEVITND QVTKSMAKKQEEKSQKAKQGLKASWTNMQFGANDLYSNFFVTPKAEVEKTSIVKTEKAVL VASADNSVTLPMFAKLSSDIDTTDTNTPTMEEIKTSKENLRGSVGNLKDKIDVARRENNK EINGLRLELIQLMEQGNQVVKSPWASWQFGVNYFYDNWGSSYKGRGDKSEKYAYEGVLER DTNLFNRYVPVSSKNYSSLAKSSNPRSAASNQREGLKSYGLASTRLAEEPKIVTQVNAGI NPKTINKQALNISAKAANAVTLPETVSFSPISPKTPVIAPPNVVIKDVTLSPLWNADDRL PDTQYIYVSGTNVVKPGSTYNLTTNYKNPNIPGYNRTKTFSADEVLKTSDGTDYTTVPGY TARGGMRDYTYGAIFEFIGGDHTIEGLTLEVDTVRERNGNIIKGVRAISTDGNNNLKVRN KSNIKLSADNVVGFATDEDPNGAGNLRQLINDTDGLIYSTGKQNVSFILVKEQDNPAATH EHINNGKIIMDGDESYAFAFSKTNGVHPNVYITHNINNGEIVMAGKENYGFALGAGRDYK VADSYIDNTAGGTISMLGNKSMAIITQSNMDHANNAGTINIAGSESYGMYTESATSMTNT GDINITDYTKNFTSNNAGGKWLDNKEYSASNAQKSIGIASGKAGSTITNSGNINISTGEN NIGAYTNIGNVVNSGNINVTNGQNIGMYVAGTGTGTNTNTGKVTVTSDGSIGLMTTGTAT LTNNGELKVTGGNNATNTTGTIGMSAGVGSTIDSTNGKATIDVTGDKSIGLYSEGTLKIG ESTIKTNNGAINYYAKDNGKIEVVTGKTSTATTGQSSLLFYTKGTGKIILNGNINATIKG GSTPSTRGTAFYYEATPGAYGTFNTAAIQNYFNTSFGNGSSTLNNLTLNMEDNSRLFIAS NVEMNLSDTAATSLMTGITNAPTITGSNYKTFMLYLSKLNINQSVDLNDPNNAYNKLEIS NSTIENANSMTGSLNRQVAIAQENGNDTNGNGYNANKVTLTNTASGVINLTGDETTGIYA KRGIITNDGQISVGKKSTGIYIVEDDRSPATATLGAKATNSSTGVITLGEDSTGMYYKIE PDNADGKGTNTAIPGGLTNAGRIESTADNIIAMSFDSPYGTKTFENLSTGVIDLQGQNST GMFATGAGAYTAKNDGTIKLASSTNVNTPNIGMYAEEVQITPAPAPKTTLVTLENNGTIE GGDKTVGIYGHNVNLGASSLTKVGAGGTGVYSKGGSVIINGGTLSVGENGTTGSNDAVGV YYVGGTGGAITSNATDVKIGNSAYGFVVQNENGAAVTLSTNTPNVTLGEDAVYAYSNNKA GSITNGTTLTSTGDGNYGIYGAGTVTNNGQMNFGTGVGNVGIYSILGGTATNNSTITVGA SDAANEKYAIAMAAGYKSSDSGNIINSPTGVINVTGKDSIGMYATGPLSTATNKGTINLS GENSVGMYLDNGATGVNDGSITTIGAPKGVKGVVLSNNSKLINNAGATININSADGFAVY RSNTPKTNVTIVNYGDITVSGGAQADGEYDATGGKELEKTVGGVTLKSPKGTNDINITAN GQAVTNIEKVTEPVGTRGDALISNLGMYVDTLRGTNPINGLGYLNIEEADLLYGVEAAEN STSKYFEVSGNILKPYQDAMRTAPQTLKWSHNSAALTWMALPTLDANGIPSKVAMAKIPY TAFAGNESSPVAVTDTYNFLDGLEQRYGVEALGTRENKVFQKLNSIGNNEETLFYQAVDE MMGHQYANTQQRIQATGDILDKEFNYLRSEWQTVSKDSNKVKVFGAKGEYNSDTAGIINY KNNAYGVAYVHEDETVKLGDTIGWYAGIVHNTFKFKDIGNSKEEQLQGKIGIFKSIPFDH NNSLNWIISGDIFAGYNKMNRKFLVVDEMFGAKGRYHTYGLGLKNEISKDFRLSESFSLR PYAALGLEYGRVSKIREKSGEIKLDVKSNDYFSVKPEIGADLIFKQYFGRKTLKVGVTVA YENELGKVANGKNKARVAGTDADWFNIRGEKEDRRGNVKTDLNIGIDNQRIGLTGNVGYD TKGHNVRGGVGLRVIF

Coding DNA - Genome Coordinates: 1150846-1144496 | Orientation: Reverse

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGAGAAATAATAATCTACATGATGTAGAAAAAAATTTACGTTCAATTGCAAAGAGGTATGAGAACGTAA AGTATTCAGTTGGTCTAGCAGTACTTTTCTTAATGAAAGGAACAAATGCATTTTCTGATAATAATATGAT ACAAGAAGCAGAAAAGCAAAAGGAAGTTATAACTAATGACCAAGTGACAAAATCTATGGCTAAGAAGCAG GAAGAAAAATCCCAAAAAGCAAAACAAGGTTTAAAAGCTTCTTGGACAAATATGCAATTTGGAGCTAATG ATCTATATAGCAATTTTTTTGTTACACCAAAAGCTGAGGTAGAAAAAACTTCAATTGTAAAAACTGAAAA GGCCGTTTTAGTAGCTAGTGCAGACAATAGTGTTACTTTACCTATGTTTGCTAAACTATCATCAGATATA GATACTACAGATACAAATACTCCTACAATGGAAGAAATAAAAACAAGTAAAGAAAATCTAAGAGGTTCCG TAGGAAATCTAAAAGATAAAATAGATGTGGCAAGAAGAGAAAACAACAAAGAAATCAACGGATTAAGATT AGAGTTAATTCAATTGATGGAACAAGGAAATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGGCTTCATGGCAATTTGGA GTAAACTATTTTTATGATAATTGGGGATCTTCATATAAGGGAAGAGGGGATAAATCTGAAAAATATGCCT ATGAAGGAGTATTGGAAAGAGATACAAATCTATTTAATAGATATGTACCTGTAAGTAGTAAGAATTATAG TTCATTAGCTAAATCAAGTAATCCTAGATCAGCTGCATCAAACCAAAGAGAAGGATTAAAAAGTTATGGT CTTGCAAGTACTAGATTGGCTGAAGAACCAAAAATTGTTACACAAGTAAACGCAGGAATAAATCCTAAAA CTATAAATAAACAAGCTTTAAATATTTCAGCTAAAGCTGCAAATGCAGTTACATTACCTGAAACTGTAAG 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