F. periodonticum 2_1_31_FusoPortal_Gene_1530

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

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FASTA file of all annotated F. periodonticum 2_1_31 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. periodonticum 2_1_31 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 2_1_31_FusoPortal_Gene_1530.out

Amino Acids: 2265

ORF FASTA file - Amino Acids

MNNNLYNVEKNLRSIAKRYENVKYSVGLAVLFLMKGTNAFSDDNKIQELEKQKDILTDVK KEKVEVKETKKVAKTTQKLKASWTNMQFGANDLYSNFFVTPKNKVEKTSIVKSEKAVLVA SADNSTSLPMLAKITSDIEETSTPTTEEINTSKENLRNSIGNLQNKIDTARKENSKEIQG LKLELVQLMEQGNQVVKSPWSSWQFGANYFYDNWGSAYKGRGDKQTNKILTRDKSATLNR FLETSADSTSYGTTNLRLVKEPSVEIKISAGVRPKNINKQAPSYRPNAPTVSLPVFEPKL LSTPGKPSAPVEVTPATFDPPDINFKGKGFFQHAHIDISRGNGLSYGPHQGQWKGIVIQN YDNYNTVDKNNDTVEGIINIEVGNLADGKKAKWWGSNLDGTANSNIQLKVHTDVPKTAAS GYNFYGPGDFYLDDGSTIVPLYTFINELRDHNATISGNYIMTNKGGENDTSRNVIFLSHN PAGPGTPGYDGKNTAGPRTATFNGTLTLNGTATPFTGATASSDVTIGVEHQLYSNGHQSA YSIFDNKGTIDLASGNNLVGILLDVEVWGDNTNNNIANNTNRLPHKTVNNGKIIINSQNS IGIDYGEYYNRFFKSDLTVGDIIVNGSHNYGLRMANIFSGNAGYFDKGTTIKSGGADKKI LVQGTENVGVSIAKFLSSAKDPNPIANITDLNVEVAGQKNIGFLRHKTYANNTGDMLFNA TTMGTFTFGNGAKDSTLIRTDKYGIQVKKDINATGKDNAGKDFTGSGNTVLHSNGQTQHI DNYNTITVGKGYTQTVGMAATGTAASKIVNILNEGTIDLQGKKSIGMYVDKFTQGKSTGS IKLSALGDLDKDGKLGDTENVGISNKGKFTFLGDIEVNGKKSSGIYNTGTTTIEVGTNPN DRTNINVANGATAIFSKGTGSSISSTAGNKLNINVNAGTTKEGLAVYAEDKSVVSLQNAN INVVGGSAGVAAYDSGTKIDLKDATLKYNGNGYATYSDGQGKIDLTNSKIELRGSSTLMD IDLSIPVSNRPITTAGTEVKVFSNDVIAINVSNLGTKNIGDLTTLMSTLGVNKIEAGTEA GQTFNKYKELAIDNGTINFNVTTDKTEVDTNPGGFFFKKVVGQRLKLNVNENLTARLSSA IANEFYGGQVVGLEANSSKKATSNTETQVNIASGKVVDVARTDGTDKGGVGVFVNYGQVN NSGTIKVEKDSDANSNAVGIYVVNGSEATNNGSVNVSGEQSIGLLGMAYRVDTSGNLVVD EFGTGAIGQGKVNIVNKGSVDLDGQGAVGMFAKNNKAGTTFTNATALNDTTGAITTTGTK SVGMAGEKANIINRGTINVNAEKGTGMFAESASRIENSGTINIVAASSTTEPNIGIFTED QDTEIHNNKDIIGGNNTYGIYGKTINMGANGKVKVGENSVAIYSNGQYASSATPNITLAS GSSIEVENNQSVGVFVTGQNQNISSQADIRIGDDSFGYVIKGTGTKLIANTTNPVTVGND TTFIYSTDTTGNIENRTRLISTGNSNYGIYAAGNVTNLADMDFSSGIGNVGMYSIAGGKI VNGSTLVNPVIKVGSSDKSNKLYGIGMVAGYTDDKGNVIQTGTVENYGTIKVDKTDSIGM YATGSGSKAINRGTIELSGKNTTGMYLDNNAVGENYGTIKTVPNPTNTGIVGVAALNGAV IKNYGSIIIDGANNTGIYLARGRREGVDPTITNGAVAVQTKKQSDTTKKVEGIEIKAKPD EPVAVTRQGNLVTPTFVDTTVAVPTASKVTVGATELDLTASELGDIPSIGMASDLGMYVD TSGVNYTNPIQGLQYLTGVNKVNLIFGTEASRYTTSKDIKVGENILKPYNDEIISLFSGG NEKKFNIASSSLTWIATGTQNSDDTFNAVYLSKIPYTAFAKDKNTYNFMDGLEQRYGVEG VNSREKALFDKLNAIGKGEPILFAQAVDEMMGHQYANTQQRIEATGNILDKEFNYLRSEW SNPSKDSNKIKTFGTKGEYKTNTAGVIDYQNNAYGVAYVHEDETVKLGESVGWYAGIVHN TFKFKDIGNSKEEMLQGKLGLFKSVPFDHNNSLNWTISGDIFAGYNKMNRRFLVVDEVFN AKGRYHTYGLGVKNEISKEFRLSEGFSVRPYAALGLEYGRVSKIREKSGEMKLEVKANDY FSVKPEIGTELAYRHHFGTSAIKVAVGVAYENELGKVANGKNKAKVAGTDADYFNIRGEK EDRTGNVKTDLNIGWDNQRIGVTANIGYDTKGHNVRGGVGLRVIF

Coding DNA - Genome Coordinates: 1616264-1609467 | Orientation: Reverse

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGAATAACAATTTATATAATGTAGAAAAAAACTTACGATCAATAGCTAAAAGATATGAAAATGTAAAAT ATTCAGTTGGACTTGCTGTACTTTTTTTAATGAAAGGGACAAATGCATTTTCTGATGATAACAAGATACA AGAATTAGAAAAACAAAAGGATATTTTAACAGATGTTAAAAAAGAAAAAGTAGAAGTAAAAGAAACTAAG AAAGTAGCAAAGACTACACAAAAATTAAAAGCTTCATGGACAAATATGCAATTTGGAGCTAATGATTTAT ATAGCAATTTTTTTGTTACACCAAAAAATAAAGTAGAAAAAACTTCAATAGTAAAAAGTGAAAAGGCTGT TTTAGTAGCTAGTGCAGATAATAGTACAAGTTTGCCTATGCTTGCTAAAATTACATCAGATATAGAAGAA ACATCAACACCTACAACAGAAGAAATAAACACAAGCAAAGAAAATCTAAGAAACTCAATAGGAAATTTAC AAAATAAGATAGATACAGCAAGAAAAGAAAATTCTAAAGAAATACAAGGTCTAAAGTTAGAATTAGTTCA ACTTATGGAACAAGGAAACCAAGTAGTTAAATCACCTTGGTCATCTTGGCAATTTGGAGCTAACTATTTC TATGATAATTGGGGGTCTGCATATAAAGGTAGAGGGGATAAACAAACAAACAAAATTTTAACAAGAGATA AGTCTGCTACTTTAAATAGATTTTTAGAAACTAGTGCTGATTCAACATCATATGGTACAACAAATTTAAG ATTAGTTAAGGAACCTTCTGTTGAAATAAAAATAAGTGCAGGAGTTAGGCCTAAAAATATAAATAAACAG GCTCCAAGTTACAGACCAAATGCACCAACAGTGTCTTTACCTGTATTTGAGCCTAAACTTCTTTCCACTC CAGGAAAGCCGTCGGCACCAGTTGAAGTTACACCTGCAACTTTTGACCCACCTGATATTAATTTTAAAGG 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