F. periodonticum 2_1_31_FusoPortal_Gene_1716

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

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FASTA file of all annotated F. periodonticum 2_1_31 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. periodonticum 2_1_31 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 2_1_31_FusoPortal_Gene_1716.out

Amino Acids: 2223

ORF FASTA file - Amino Acids

MNNNLYKMENTLRSLAKRYKSVKYSLGLVLIFLMLGINAFSEEIFTTEQVSTSKKNIKAS VENLKDKVEQVKEKNEKDIKNLRLELIQLMEQGNQVVKSPWASWQFGVNYYYDNWGGTYR GRGDKTEKYPYEGILERDTNEMYRYIATNSAMYSNLSKSTNVRSASTNRRKGLSNYGIAS NISQKEPIVSLELNAGISPRVINKKSPNTAPTPPDILLPTFEPKFVNPPVIPNAPHSPTL TLPSFNVNVGSSNNGSKKVILGYGDNSLIQEVAITGGDFKIKRNPIRAAYNGTQGTVPSG TPPMWHYSFVNYSGKSPFASVQGGHQFPSTITNAMGGVSWKPLGYSWSGLNEPGTDAENT ATPYQKNLAFLAVNKGAMLNNANFLYTNPIMTSQLLKEFVHQDVHGGIATATIRNGIVDS VGSSSSLVTAYDDMVAYQTTAIQQSLVPYSGITEQHTFLNGGKVIIEGANTSLGNTYSHM EGSKVRQSTINTGDIIFQPYSDGTNIFEKNTAVFVISNDTHETTSSGAIVPQIQDSINYN AGKIKMYTTNAVGLVTDPEQKRPVSLINRDTFELYGENSAAIYLKNAVALDIQTTNDKNF TLDTKDNSNSTLSTNSSYKPIKISGDKSIGLYSVASGSTVEGNFALDIGAIGVGNEKFTT TTISNLTDGVNLTNHSINTSGSTDDIEGSYGILSKSPTDLTSHQIRIFDKAVGNVGVYPA DNVELKLGGGSIELNGGSTAKDNIGIYIDGQGAVTSTGSIKLDGGVGNLGIYAKGGNLPI GVSNNVTVREIKGSGTKNTVFIYGSDGAKIKLSDGTLPNGTALSKGATYGLNISNATVDT DASTSNKKDTGAVFATGVGTEISINKTATLSTTASPNINITGTKLTDPGTEKYVGFGLMA KDGATIRAKNNYIKITNGSTAVASVGSGSKVEMNGGKIDYTGKGYALYATPGNTIDISDV KLTLDGNAVAYERDLATSFPIITDTNTSIHIKSKDVVVLNVKHASPLNVSSLVSTVVNSW AGLSTIPTYDAGAINYKMTTIDGLSAYNIDQDINKKNVVLGTADNNSKLFVRNMSIQRAK MNLASGKNVTAYLDASDLTNLETSTVIGLDMNSSANAAGRNETQINLASGSSVNADRIDA GSGAIGLFINYGETNIASGAKVNVEKSGLNDANAKAVGVYAVNGSTVNNEGEINVGGEGS IGVLGISYRKDSNGVLKRNEFGAKPNAGDVGVVNKGKIELDGKKAVGIYIENNDSNTSAP HTIEATNDTNGTINMSGQEAIGMAAKLGNLVNKGTINITADKGTGMFVETDGVRPATMTN DSTGTISIGDSTSESVLRTGMFTKNQNVKITNKGKIDAGKNSYAIYGKDVQLTSGSELNI GDNGVGIFSTSTTPATPNIDIQAGAKINLGKDEAVGVFLGTDAATGVQATGVRINDAGSI MNIGDNSYGYVLKGTGTTFTNSSSGSVTLGTKSVYLYSDDTTGNITNNVALTSNGSTAGT ALTSATGGQNYGIYSAGTVVNNANIDFSKGIGNVGIYSIKGGTATNNATITVGDSNAQGN LYSLGMAAGYARTDSGNIINNGTINVVGKDAIGMYASGPGSTATNNAGHTINLSGDGSMG MYLDNGAIGVNNGTITTVGNPKEAVGVVVRNGAEFTNNGIVNISSKDGYAKYVKGGIIKN YGSFVVSNGATEDYAVGNKPTGKELIVNGVKVVDINAPLGATTATITINGIPHTPVITNI SGTRSMLTSNVGMYIDTLRGTNPISGSLGILGDSADLIVGSEAAQTTTSRGIQVPNRIIA PYNVVMATNPSIRYWNIYSGSLTWIATATLNKTTGLIENMYLAKIPYTAFAGNEATPVAV TDTYNFLDGLEQRYGVEELGTRENRVFQKLNSIGKNEEALFYQATDEMMGHQYANVQQRI VATGDILNKEFDYLRSEWQTVSKDSNKIKTFGVRGEYNTDTAGVINYTNNAYGVAYVHED ETVKLGDTLGWYAGIVHNTFKFKDIGNSKEEQLQGKVGLFKSVPFDENNSLNWTISGDVF AGYNKMHRKFLVVDEVFNAKGRYHTYGLGLKNEISKEFRLSESFTLKPYVALGLEYGRVS KIREKSGEIKLDVKSNDYFSVRPEIGAELGFKHYFDRKTVKVGVTVAYENELGRVANGKN QARVSGTEADYFNIRGEKDDRTGNVKTDLNIGVDNQRVGVTANVGYDTKGNNVRAGVGLR VIF

Coding DNA - Genome Coordinates: 1807540-1800869 | Orientation: Reverse

ORF FASTA file - Coding DNA

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TGTAGAAACAGATGGAGTTAGACCAGCAACTATGACAAATGACTCTACTGGTACTATTTCAATAGGAGAT TCTACAAGTGAAAGTGTTCTAAGAACAGGAATGTTTACTAAAAACCAAAATGTAAAAATAACAAATAAAG GTAAAATAGATGCTGGAAAGAATTCATATGCTATCTATGGAAAAGATGTACAATTAACATCAGGATCTGA ATTAAATATTGGAGATAATGGAGTAGGAATATTCTCAACATCAACAACTCCAGCAACACCTAATATTGAT ATACAAGCAGGAGCTAAAATTAATTTAGGTAAAGATGAAGCAGTTGGAGTATTCTTAGGAACAGATGCAG CTACAGGAGTTCAAGCTACTGGAGTTAGAATAAATGATGCTGGAAGTATTATGAATATAGGAGATAATTC ATATGGATATGTTCTAAAAGGAACAGGAACTACTTTTACAAACTCAAGTTCTGGTAGTGTGACTTTAGGA ACAAAATCAGTTTACTTATACTCAGATGATACTACTGGAAATATAACAAATAATGTTGCATTAACTTCAA ATGGTTCAACTGCAGGGACTGCATTAACAAGTGCAACAGGTGGACAAAACTATGGAATTTACTCAGCAGG AACTGTAGTAAATAATGCAAATATAGACTTTTCTAAAGGAATAGGAAATGTTGGAATTTACAGTATTAAA GGTGGAACTGCAACAAATAATGCTACAATAACTGTAGGAGATTCAAATGCACAAGGAAACCTATATTCTT TAGGTATGGCAGCAGGATATGCGAGAACAGATAGTGGAAATATAATAAATAATGGAACAATAAATGTTGT AGGAAAAGATGCTATAGGAATGTATGCATCAGGACCAGGTTCAACTGCAACAAATAATGCAGGACATACA ATAAATCTATCTGGTGATGGTTCTATGGGTATGTATTTGGATAATGGAGCTATAGGTGTAAATAATGGTA 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