F. periodonticum 2_1_31_FusoPortal_Gene_1880

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

Link to full Interpro analysis


Previous Gene Next Gene

Return to complete Genome Map of F. periodonticum 2_1_31

FASTA file of all annotated F. periodonticum 2_1_31 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. periodonticum 2_1_31 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 2_1_31_FusoPortal_Gene_1880.out

Amino Acids: 981

ORF FASTA file - Amino Acids

MKNSKKVFGLFAFLLVCSNANAGSVGMPEVYPGIRYDYNNVNVSLPAFNFTENLTDGGNY IRVEGNSTLDIASNLDINLTSNIPSTGAYGNLVGFGAYGTNNGAPTINAKDVKIKVEAGA ADYHNEPFGMLIRDGANYSGGNIDINLITNSNHSASDITALSYGLDNENVTREYNSTMKV KDVNIKIVNNQVLTNGIDDNNLIGLDQMGEGNQNTNFVSTGNLNIDIDDKSNSAPYHIAA GIVIEGDSGTKMTLNNSNIKIKSKTNNDYLGGAIILGFPDYEATTTGQGATLESKGKMVL DTTEAPDVATLNLHGHGSLFKADFENSSAEIKSGGTAIRFAGISQALNADGEDTKPGRDL TISLKNAKITTSATAPHSAPLIVVEDGVKNATFNLSGPGSEAIAADQNELLLIKGNDTDV TLNIDNGAKIKGTIYRATSGEITTNITNNAVWSSPAGSGSTYSSNLTLKDGGTLDLTDET HPDTRGINYYEIKIFNRAEDGGKILNDNGIITMANTSYNDEVEIYGNYEGKNGAKIKMNT LWNAPGDADGANSQSDILKILGGGTSKYGFATGVTEIIPIALDGRVNIIEGNIQKVAQAV NTVPVVVADKAAAGTFVGTAQTTGAGEVQLTSKLNSNGQRVFFWTLNAIDGTNPYDDGTS RNYRLGKARTILNSSVAGYINTAKVNMDSGFTSLSTLHERRGENALDVNNKKGQAWARII GKHSKDEGKERFNYETDIYGVQAGYDFNIKNSEDGNRYTGFYFTNTTASTDFYDRYRAQN GIIASDKYTGKVKTKDFSLGLTTTKYYNNGFYLDLVGQLSFINNKYNSRDGVSAKQKGNA LALSVEGGKNYSLGSNWAIEPQAQLIYQYLNLKDFNDGVREVHHGNDSALRARLGFRTTY KKAFYSIANVWHDFSNTTEANIGSDRIKEKYSATWGEIGLGVQLPITNSAYVYSDIRYER SFTSNPKHKGYRGTVGFKYTF

Coding DNA - Genome Coordinates: 1987102-1984157 | Orientation: Reverse

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGAAAAATTCAAAAAAAGTTTTTGGGCTATTTGCCTTTCTGCTAGTATGTAGTAATGCAAATGCTGGAT CAGTAGGAATGCCTGAGGTATATCCTGGTATTAGATATGACTATAATAATGTCAATGTAAGTCTTCCAGC TTTTAATTTTACAGAAAATTTGACTGATGGTGGAAACTATATAAGAGTAGAAGGAAATTCTACATTAGAT ATAGCTTCTAATCTAGATATTAATCTGACAAGTAACATACCGTCAACAGGAGCATATGGAAATTTAGTAG GTTTTGGTGCATATGGAACAAATAATGGAGCACCTACTATAAATGCTAAGGATGTTAAAATAAAGGTTGA AGCTGGAGCAGCTGATTACCACAATGAACCTTTTGGAATGTTAATACGTGATGGGGCTAATTATTCTGGA GGAAATATAGATATAAATTTAATTACAAATAGTAATCATAGTGCATCAGATATAACAGCTCTATCTTATG GGCTAGATAATGAAAATGTAACAAGAGAATATAATTCAACAATGAAAGTTAAAGATGTAAATATAAAAAT AGTAAATAATCAAGTTTTAACAAATGGAATTGATGACAACAACTTAATTGGATTAGACCAGATGGGAGAA GGAAATCAAAACACAAACTTTGTATCAACAGGAAATTTGAATATAGATATAGATGATAAATCGAATAGTG CTCCGTATCACATAGCAGCTGGAATAGTTATTGAAGGTGATAGTGGAACAAAAATGACTTTAAATAATTC AAATATTAAAATAAAGTCAAAAACTAATAATGACTATTTAGGAGGAGCTATTATTTTAGGTTTTCCAGAT TATGAAGCTACAACAACAGGGCAAGGAGCAACTTTAGAATCTAAGGGAAAGATGGTTTTAGATACTACAG AAGCACCTGATGTGGCAACATTAAATTTACATGGACATGGTAGCTTATTCAAAGCAGATTTTGAAAATAG CTCGGCTGAAATAAAATCAGGAGGAACTGCTATCAGATTTGCAGGAATTTCTCAAGCATTAAATGCTGAT GGAGAAGATACTAAACCTGGAAGAGATTTAACTATAAGTTTAAAGAATGCTAAAATTACAACTTCAGCTA CAGCGCCTCATTCTGCTCCTTTAATCGTTGTTGAAGATGGTGTTAAAAATGCAACTTTCAATTTATCAGG TCCTGGAAGTGAAGCAATAGCAGCTGATCAAAATGAATTACTTCTAATTAAAGGAAATGATACTGATGTA ACTTTAAATATAGATAATGGTGCTAAAATTAAAGGAACAATCTATAGAGCTACTTCTGGTGAAATAACAA CTAATATTACAAATAATGCTGTTTGGTCGTCACCAGCTGGAAGTGGAAGTACTTATTCTTCTAATTTAAC TCTAAAAGATGGTGGAACTCTTGATTTAACAGATGAAACTCACCCAGATACTAGAGGAATTAATTATTAT GAGATTAAAATTTTTAATAGAGCTGAAGATGGAGGAAAAATTCTTAATGACAATGGAATAATAACTATGG CTAATACTTCATACAATGATGAAGTTGAAATTTATGGTAACTATGAGGGTAAAAATGGAGCTAAAATTAA AATGAATACATTATGGAATGCTCCAGGGGATGCAGATGGTGCAAACTCACAATCAGATATATTGAAAATC TTAGGTGGAGGTACTTCAAAATACGGTTTTGCTACTGGAGTTACAGAAATTATTCCTATAGCCCTTGATG GAAGAGTAAATATAATAGAAGGAAATATTCAAAAGGTAGCTCAAGCAGTAAATACTGTACCTGTTGTAGT TGCTGATAAAGCAGCTGCTGGAACTTTCGTAGGAACTGCTCAAACAACAGGTGCTGGAGAAGTTCAACTT ACAAGTAAACTAAATAGTAATGGTCAAAGAGTTTTCTTCTGGACATTGAATGCTATAGATGGAACTAACC CTTATGATGATGGTACAAGTAGAAATTATAGATTAGGAAAGGCTAGAACAATACTTAATTCATCAGTGGC TGGATATATAAATACAGCTAAGGTAAATATGGATTCAGGTTTCACTAGTTTATCAACTTTACATGAACGT AGAGGAGAAAATGCACTAGATGTAAATAATAAAAAAGGTCAAGCTTGGGCTCGTATAATAGGTAAGCATT CAAAAGATGAAGGAAAAGAAAGATTTAATTATGAAACAGATATATATGGAGTACAAGCAGGATATGATTT TAACATAAAAAATTCTGAAGATGGAAACAGATATACAGGATTCTATTTTACAAATACAACAGCAAGTACA GATTTCTACGATAGATATAGAGCTCAAAATGGTATCATAGCTTCTGATAAATACACAGGTAAAGTTAAGA CTAAAGATTTTAGTTTAGGTCTTACAACAACAAAATACTATAATAATGGTTTCTATTTAGACTTAGTAGG ACAATTATCTTTTATCAATAATAAATATAACTCAAGAGATGGAGTGTCTGCTAAACAAAAAGGGAATGCT TTAGCATTATCAGTTGAAGGTGGAAAAAATTATAGTCTAGGAAGTAATTGGGCAATTGAACCACAAGCTC AATTAATCTACCAATACTTGAATTTAAAAGATTTTAATGATGGGGTACGTGAAGTTCATCATGGAAATGA CTCTGCTCTTCGTGCTAGATTAGGTTTTAGAACTACATATAAAAAGGCGTTCTATTCTATAGCTAATGTA TGGCATGATTTCAGTAATACAACAGAAGCAAATATAGGTTCTGATAGAATTAAAGAAAAATATTCTGCAA CTTGGGGAGAAATTGGACTAGGAGTACAACTTCCAATAACAAATAGTGCTTATGTGTACTCAGATATAAG ATATGAAAGATCATTCACATCAAATCCTAAGCATAAAGGATATCGTGGAACAGTTGGATTTAAATATACA TTCTAA

Previous Gene Next Gene