F. nucleatum 23726_FusoPortal_Gene_2067

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

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FASTA file of all annotated F. nucleatum 23726 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. nucleatum 23726 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 23726_FusoPortal_Gene_2067.out

Amino Acids: 2122

ORF FASTA file - Amino Acids

MRNDLYKVERDLRSIAKRYNSVKYSLGLAILFLMLGGDAFSQEINDGNVTTNTIPTREQI TSSKENLKNSVNNLQSKIDDARAENEKGLAGLKLKLIQLMEQGNQVVKSPWASWQFGINY MYEQWGSSYKGRGDKPSYEGIFTRSDDIFQRYIHTASTHYSSLLTGNDSTQASANLNGKN SSHFGTTDLQLIEEPIVEVEVSAGVKPRQPKKMEPLTVRVNHNLSFTVPKLPDFEIPDEK VITGKTTPSSGDEIPALGASALYSKNITPRVVTEPQAKDDTIAPIQNTDISNGKIDITFD GKIKTVGANKEIDEENSTMKYSTQGVNFVGKTRGVTDFTYSNHTHNSQKFKYKNYSSIIN YVMGHNDFSINNTTITIGGRNYAHLRSAISIEGDDFSTGASAPNKITTLTIGENTKIFQK TDGSTILFNTLNGKYGNLVNKGTIEVTGKKGSAIDFAYPDNPPENLHPIVENAITGKIIG GGHLPTTEEDYLKIKRGEFVGDGGNTGLVREIAGGRTKSGYHFIQNGTFELRGYRQFGFF TSNNEGTRIYEINKPIKLLGKDGYGMTFYNIGKNFYTEGTIVNKGSYEIMVPRGETGYNS NNVKKSIFRIHMSGEENTALYFIQARNNYKVDSHKNFNIDSVDIVSENAKNNTLVRLERV DNFNLGGEGQYHNLLMKKEKGWKSRLITAHDSTNIKIHEKMEMGVFNSDNVTGITIQNSK RTDSNLTNRGKLVMTGNTSIKSVKDMKPEDLTEAGKGMRGFLANNKATLTNHGDFLFYGG GYKGYAEYYGDDPNDSTKVKFFSKYLERGSYGMNAKYGGKIVSTGVAYIHVKDKKSVGLF ASESKDNISPEITISNAKVIAEDGAINAVANKSGIINFKDNNVLFTKKNALTFLTGYANG VADGKFNIQGNLKAEIEKDGTAFYYTLPNSGNFDFVSWYNANFNHSAGKKLTLNMREGGR VLLLANGKVNLTSLPSMDFSSGALSSLAGKLEITGSRNYIPYSLIESNLKVDRDVNLDSN TDSYNKMQITQSSIVNEKTIAGTKAKQVAIAQENANVKEADKVSLTNKGTIQLTGKKSTG IYGKRGVLLNDSTGKISVGEESAAMYLLEDNKATTMGGKVSNLGDISLGKGSIGIYYSDK DKDGNVFTGSNSNTVGGAYNLKNILSSSENVIGMYLNSDNMAATNNKKYINESTGLIQLL GEHSIGMFAEGNGNYSTENKGRIVLGNASSLINANIGIFAKNEKTFIKNSGSITGGKNTV GLYGYQITTTNTSKIIVGDSGIGVYSGKGNLNLAGDLKIGDKEAKGVYLVGNSAQNVVYK FSNITLGNGSFGLVNIGKNKTITSTVSQVTLNNRNMFMYSEDDLGSITNHTALRSNGDQN YGIYSSGTVTNYGSIDFRNGKGNVGLYGTNKDRVVKNVGNIYVGASQPRENYSIGMAGGY YNTDTNTLVNTGNIENTGNIEVHGERGIGMYATGYGSKAVNRGHIKLIGARSIGMYLDQH ATGENYGTIEATADAIGAVGAVAMNGAIFKNYGQIKLLPAAGSIGTYSGKDSITEDNATL GGQTGTVEAGTKHYSRTASNETEKTVVDETGKPTVKIETKKNPTRVEINGKVVPPTKVDT NSVTNPNYLSVNPGEKSIEDKFTTNRKNNGRIGSIGMYVDTSGVNYTNPIQNLNLLSPKT KVDLIFGIEAAEYTNAKVIQIGEKILKPYNDAMAQATGKKWQIYSASLTWIATAKMNVDG MENAIMAKIPYTNFAKKSDSYNYPFTDGLEQRYGVEALGSRENQVFQKLNGIGKNEPILL AQAFDEMKGKQYANVQQRVQATGNILDKEFKYLKKEWRTASKNSNKVKTFNTKGEYKTNT AGVVDYKNTAYGVVYLHESEDIKLGKGIGWYTGIVNNTFKFKDIGNSKEEQLQAKIGLFK SVPFDDNNSLNWTISGDVFAGYNKMYRKYLVVNEIFNAKSKYYTYGVGVKNEIGKEFRMS EDFSIRPYGALKVEYGRTSKIKEKTGEIKLEVKSNDYFSVKPEIGTELAYKHYFETKSLT ASVGLAYENELGKVANGKNKARVAGTTADWYNLRGEKEDRKGNVKTDFNIGLDNQRIGVN ANVGYDTKGHNVRSGVGLRVIF

Coding DNA - Genome Coordinates: 2243534-2237166 | Orientation: Reverse

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGAGGAATGACCTGTATAAGGTAGAAAGAGATTTGCGTTCAATAGCCAAAAGATACAATTCAGTAAAAT ATTCATTAGGTTTAGCAATACTGTTTTTAATGTTGGGAGGGGATGCATTTTCACAAGAAATAAATGATGG AAATGTCACAACAAACACAATCCCAACAAGAGAACAAATAACATCATCAAAAGAAAATTTAAAAAATTCA GTAAATAATCTTCAATCAAAGATTGATGATGCAAGAGCAGAAAATGAAAAAGGTTTAGCTGGATTAAAAT TAAAATTAATTCAATTAATGGAACAAGGGAATCAAGTAGTAAAATCTCCTTGGGCTTCATGGCAGTTTGG AATAAACTATATGTATGAACAATGGGGATCTTCATATAAAGGAAGAGGAGATAAACCAAGTTATGAAGGA ATATTTACTAGAAGTGATGATATCTTTCAAAGATATATTCATACAGCAAGTACACATTATTCAAGTTTGT TAACAGGAAATGATTCTACACAAGCAAGTGCTAATCTAAATGGAAAAAATTCTTCTCACTTTGGAACAAC TGATTTACAATTGATAGAAGAACCAATAGTAGAAGTCGAAGTGTCAGCAGGTGTAAAACCAAGGCAACCA AAGAAAATGGAACCATTAACAGTGAGAGTAAATCATAATTTAAGTTTTACAGTACCAAAACTTCCAGATT TTGAAATTCCAGATGAAAAAGTAATAACAGGAAAAACTACTCCTAGTAGTGGAGATGAAATTCCTGCTCT TGGAGCATCAGCACTTTATAGTAAAAATATAACTCCTAGAGTAGTAACAGAACCACAAGCAAAGGATGAC ACTATTGCTCCAATACAAAATACAGATATTTCTAATGGTAAAATAGATATTACTTTTGATGGAAAAATTA AGACTGTAGGTGCTAACAAAGAAATTGATGAAGAAAATAGTACAATGAAATACAGTACTCAAGGAGTAAA 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