F. nucleatum 23726_FusoPortal_Gene_60

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

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FASTA file of all annotated F. nucleatum 23726 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. nucleatum 23726 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 23726_FusoPortal_Gene_60.out

Amino Acids: 2361

ORF FASTA file - Amino Acids

MSNNLYKVEKNLRSIAKRYKSIKYSVGLAILFLMLGVGAFSEEVNDTQLNNVPTREEIAS SRENLKNSVGSLQSKINQARAENSKGLEGLRLELIQLMEQGDQVVKSPWMSWQFGANYMY SKWNGTYKGKGDKAEKYPFEGMFTRSTNLFERAVSPLSEKYKELATSTNPYSASSNARNG LGSGYGLASTTPRQEPLVAINIEASIRPKDVTRSAVSAPTVGVGAPRLDTLNVPSSEPLS VTPPDPKAPEKTVSIVQPNASPFTGFFFDADYNAINFSAYNNGKKNADADLSDVDLYSGL EYNSWANGNTNPQGAAKTGYKKGDTHTEVTNLNTVDVNDGNHNVQKVGRTTNIIYRRGNT NGTPVNLSNLNIYVRGYYDGTLSGGKGTTGGKMDGWIDSGRGAEGGSADPDPLNPTRGTI GLHTLLNAKVSKVTANLYGRAGFLTSETWRSGTVTMDRTTVNVYNDQNSVFYIMPAAYGT IAAYLSAGGSHDNFYIGGLKGSTNVNLYGTGNSVYLSTGISGARHIENKGIINSDGASNI VYSNIGYTPDWSKTWYQDRGGAAGNRPLQNGYTKNIMRSVIKLGTDGGQVNLYGDENVGL FFGSKMGGADPKSWEKGHRDAEFKNANYLRKASFIGIYQGEIELHAKIGEKTSSTGKDQV NGVGNIHENTPNGKKYDPKFVEGAVGIYSESGQREGIDPIRDLGVPTKANGGSGHYTHIG SLNNDKVHNLQVGKVDVKFGSKSKNGFMFISKLGTVMDIAKPGTAKDYIGTLSEEITDGM NGENTTEEDASTGTTIAYAEGTWDQGKHQLGSTAAEKAKNDNKAAGSTANKLQGLGSEIN IFTPKVTLASKEGIAYMGDNKGIINVGTTANKVKTTAVNHKSIIGFARDEGTVTINGNVE AKDAKAQTNKWQNIAGLAVKTKTGTKGGTVTINGDVDIHGMAGFADGTGSKVDLKGTGNK VSTGTDGALAAKNGGVVNFGGGTITHKNNGTVVGKNDHESSVPFYADNNSKINFEGDGTN PSRTTIEMADGVLMSEEATAYNGLNDGKAKYNGMKNVTVKLIGDNVILKTSIGKDITWTG ASGLVASLKSDMKLGGLDLGTHKYKVYYLNGTFKIDTNIDLDDSKIAFHNVGLSNEMVTI NTGREIKSATGKGLAVASNKNAITNASSGYINKGNINITGGSLASGTIGLNVSYGTVRNE KNINVANGIGVYGINGSKLVNETSGKINIGTQGVGMAGFASAGARKNYGTDKLNSSSPFF NTEKLFEIENNGTIQANGDKSIGLYGETNDLYGRGLTSSNGSITNNGKLILTGNKAVGIV SKRATVKLNGTGSSDIVLGKEGIGVYAENSLVNLNSNYGIEVKDKGTGVYVDKDSEIITP GRTVELKYTGSNTGTGVGLFYEGKTAAIMTNGTNVKLIDTVGTTGGLVGLYTNNGGILTN NGNISGDKGYGIITDGTEINNAGNITFNNPVTSKNASVGIYTKSSDKITNSLIGKIKLGK NSVGIYGKAVENSGEIEVGDGGTGIYSGGGNVNLNSTGKINVGRDKAVAIYAKGTNQNIT AHSGSTINLGNTSFGIINEGTNNKITSNIANINNLGNDTVYIYSTDTRGRVTNNTNLKST GYLNYGIYSAGTVENKGNIDFSSGYGNVGIYSIKGGNANNTGNITVGKTMEISTPTASDP TKTTTYYAIGMAAGYTPESGTGYTGNITNTGTINVNGDGGSIGMYGTERGTRVINNGTIN LRANNSVGMYLDNGAYGENNGTIQTIGTGLKKVTGVVVKNGSRFKNNGTVKLDAESAIGL LTKGGPGGANPGIIENYGTLDIKGVGAQRTKESKGTDPLEKEMGGVAIKTPKNSSTSQIT VDGKVVKPTVVETSAKEYQDMSLSTIGMYINTSGTKFTRPITGLSALKQLKRADLIIGVE AAQNTTSKTIQVGQKILEPYNKTIKDNPQIEKWNIYSGSLTWMANIAQNQTDGTIQNAYL AKIPYTHWAGNESTPVDKKDAYNFLDGLEQRYGVEEIGTRENQVFQKLNGIGKNEQILFF QAVDEMMGHQYANVQQRVQTTGIILDKEFKYLRDEWRTASKDSNKIKVFGTNGEYKTDTA GVIDYKNHAYGVAYVHENEDIKLGRGIGWYTGIVHNTFKFKDIGKSKEHMLQAKVGLLKS VPFDDNNSLNWTISGDIFVGRNRMHRKYLVVDEIFNAKARYYTYGIGVKNEIGKEFRLSE SFTLRPYAALKLEYGRVSKIREKSGEVKLEVKQNQYFSVKPEIGAELGFKHYFGMKALKT TLGVAYENELGRVANGKNKARVVDTSADWFNIRGEKEDRRGNVKFDLNVGIDNTRVGVTA NVGYDTKGENLRGGLGLRVIF

Coding DNA - Genome Coordinates: 81431-74346 | Orientation: Reverse

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGAGTAATAATCTATACAAAGTAGAAAAAAACTTACGTTCAATTGCGAAAAGGTATAAGTCAATTAAGT ATTCAGTTGGCTTAGCAATTTTGTTTTTAATGTTAGGAGTAGGAGCATTTTCTGAAGAAGTAAATGATAC ACAACTAAATAATGTACCAACAAGAGAAGAAATAGCTTCATCAAGAGAAAATTTAAAGAATTCAGTGGGA AGCTTGCAATCTAAAATTAATCAAGCAAGAGCAGAAAATTCAAAAGGCTTGGAAGGATTAAGATTAGAAT TAATTCAATTAATGGAACAAGGAGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAGCTAA CTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATAAGGCAGAAAAATACCCATTTGAA GGTATGTTTACAAGAAGTACAAATCTTTTTGAAAGAGCTGTTTCTCCTTTAAGTGAAAAATACAAGGAGC TAGCTACTTCAACAAATCCTTATTCAGCTTCTTCTAATGCAAGAAATGGTTTAGGTTCAGGATATGGATT AGCAAGTACAACTCCAAGACAAGAGCCTTTAGTAGCAATTAATATTGAAGCATCAATAAGACCAAAAGAT GTTACAAGAAGTGCAGTGAGCGCACCCACTGTTGGTGTAGGAGCACCTAGATTAGATACATTAAATGTTC CTAGTTCAGAACCATTATCAGTAACACCACCTGATCCAAAAGCACCAGAAAAAACAGTGAGTATTGTACA ACCAAATGCAAGTCCATTTACTGGTTTCTTTTTTGATGCTGATTATAATGCAATAAATTTTAGTGCTTAC AATAATGGAAAAAAGAATGCTGATGCAGATTTGTCAGATGTTGATTTATATTCAGGATTAGAATATAATT CTTGGGCAAATGGAAATACTAATCCTCAAGGAGCAGCTAAGACAGGTTATAAAAAAGGTGATACTCATAC 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