F. varium 27725_FusoPortal_Gene_1932

InterPro predicted function: WavE lipopolysaccharide synthesis
InterPro Accessions: IPR011122

Link to full Interpro analysis


Previous Gene Next Gene

Return to complete Genome Map of F. varium 27725

FASTA file of all annotated F. varium 27725 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. varium 27725 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 27725_FusoPortal_Gene_1932.out

Amino Acids: 347

ORF FASTA file - Amino Acids

MKLKYKNKLKRIIAKYIPKALIMIIIKLDPKDLKDKTDYFWQLKYFKKKIENFSKYKLVY KNNFKVGIIMQGPIIIEESFTYNSLKLLKFNYPHCEIVLSTWKDQKKEEIEKIEQLGIKI LKNNYPEKGMENLNYQITSTIAGVDYLKKLNVEYVMKTRTDQRIYDINLDIYLINLLKEY PINNKFQKERIIGIGDNTYKYIPFSFSDMFQFGNINDIEVMWSLPLTKRRFTIEDRIKIN PTIKEMQKFSNCEMYLCISFLKRTNYKIEYTLESYYKSLKERFLIVDNINIYWFKYNSLK DKTENFLLKDEKMTYNDWTNLYKSFNNIDFRILNEIELKIFQTKLYK

Coding DNA - Genome Coordinates: 2133136-2134179 | Orientation: Forward

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGAAATTAAAATATAAGAATAAATTGAAAAGAATAATAGCAAAATATATACCTAAAGCTTTAATAATGA TAATAATAAAGTTAGATCCTAAAGATTTGAAAGATAAAACAGACTATTTTTGGCAGTTAAAATATTTTAA AAAAAAAATAGAAAATTTTTCAAAATATAAATTAGTATATAAAAATAATTTTAAAGTTGGAATTATAATG CAAGGTCCAATTATAATTGAAGAAAGTTTTACATACAATTCTTTGAAATTACTTAAATTCAATTATCCAC ATTGTGAAATAGTTTTATCTACTTGGAAAGATCAAAAAAAAGAAGAAATTGAAAAGATTGAACAATTAGG AATAAAAATTTTAAAAAATAATTATCCTGAAAAAGGAATGGAAAATTTAAATTATCAAATAACATCAACT ATAGCAGGAGTGGATTATTTAAAAAAACTTAATGTAGAATATGTAATGAAAACTAGAACTGACCAAAGAA TATATGATATAAATTTGGATATCTATTTAATAAATTTGTTAAAGGAATATCCAATAAATAATAAATTTCA AAAGGAAAGAATTATAGGAATTGGGGATAATACTTATAAATATATACCCTTTTCTTTTTCAGATATGTTT CAATTTGGAAATATTAATGATATAGAAGTAATGTGGTCCTTACCTTTAACTAAACGCAGGTTTACTATTG AAGATAGAATTAAAATAAATCCTACTATAAAAGAAATGCAAAAATTTAGTAATTGTGAAATGTATTTATG TATAAGTTTTTTAAAAAGAACGAATTATAAAATAGAATATACATTGGAATCATATTATAAAAGTTTAAAA GAAAGGTTTTTAATAGTTGATAACATAAATATCTATTGGTTTAAATACAATTCATTAAAAGATAAAACAG AAAATTTTTTATTAAAAGATGAGAAAATGACATATAATGACTGGACGAATTTATATAAAAGTTTTAATAA TATTGATTTTAGAATTTTAAATGAAATTGAGTTGAAAATTTTTCAAACTAAATTATATAAATAA

Previous Gene Next Gene