F. varium 27725_FusoPortal_Gene_2033

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: noIPR

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FASTA file of all annotated F. varium 27725 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. varium 27725 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 27725_FusoPortal_Gene_2033.out

Amino Acids: 554

ORF FASTA file - Amino Acids

MSSEDRKYSLIIFILSLVSFFPNLWVKDADLMEARNFITSREMVESGNWLIPTLNGNLRF EKPPLPTWITAGMMKLFHNTTDEYLLRIPVAIVSIILIFLIYYLVKILTEKSLYSFIAAF ISLTTFMLIKTGNENSWDMYSYAFAFGTVVFFTAGMKKEKIKNFIISGIFLACSILSKGP VALYGLILPFIVSYGYIYGMENYKKNWKGILIVLGTAVLLSGIWPVLMLLNYKDIFLSVM EKEKDTWNSKHTQGILFYLDYFVYMGIWIFFSAFGMVKKWSKERAEDKKFFNFVFLWNLL VLILLSLIKMKKKRYGIPIYITSSLMVSSICSYYYQKTWNELKKSDRVLFHIQSIFIWIV SLGIPIFLFVGGYIKRDVSLSYILIILTIMIPFYCWLYIAKNHKAKIKNIILGSGILMLI ANNSTNWFIEREIREKNDKSIPKISMAKKIPIQWEIYSDDFEIEDVWNIGKKINKLDDKV LLKDEFVILENDELDMEKFKNYFIADKKIFTRGNNDIVKLFYLEKLEDMNEDFDNRSSRI YRVAFNRGAAEIKK

Coding DNA - Genome Coordinates: 2243600-2245264 | Orientation: Forward

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGTCTAGCGAAGATAGAAAATATTCATTGATAATTTTTATTTTGTCATTAGTATCATTTTTTCCAAATT TATGGGTAAAAGATGCAGACTTAATGGAAGCAAGAAATTTTATAACATCTAGGGAAATGGTAGAAAGTGG AAATTGGCTGATACCAACATTAAATGGGAATTTGAGATTTGAAAAACCACCTCTTCCAACATGGATAACA GCAGGAATGATGAAATTATTTCACAATACAACAGATGAATATTTATTGAGAATACCTGTGGCTATTGTAT CGATTATATTAATATTTCTTATTTACTATTTAGTAAAGATATTGACAGAGAAAAGCCTTTACAGCTTTAT AGCAGCATTTATCTCCCTTACAACTTTTATGCTGATAAAAACAGGGAATGAAAATAGCTGGGATATGTAT AGTTATGCTTTTGCTTTTGGTACAGTAGTTTTTTTTACTGCTGGAATGAAAAAAGAGAAAATAAAAAATT TTATTATAAGTGGAATATTTTTAGCCTGTTCCATATTAAGCAAGGGACCAGTAGCACTTTATGGTTTGAT ACTTCCCTTCATAGTTTCATATGGATATATCTATGGAATGGAAAATTATAAAAAGAACTGGAAAGGTATT TTAATAGTATTAGGTACAGCAGTTTTATTGTCAGGAATATGGCCAGTACTGATGTTATTAAATTATAAAG ATATTTTTTTAAGTGTAATGGAAAAAGAGAAAGATACATGGAACTCAAAACACACACAGGGAATATTATT TTATCTGGATTATTTTGTATATATGGGAATATGGATATTTTTCTCGGCATTTGGAATGGTAAAAAAATGG AGCAAAGAAAGAGCAGAAGACAAAAAATTTTTTAATTTTGTATTCTTATGGAATTTGCTGGTATTGATTC TGTTATCTTTGATAAAAATGAAAAAGAAAAGATATGGAATACCCATTTACATAACTTCAAGTTTAATGGT CAGTTCTATATGCAGCTACTATTATCAAAAAACGTGGAATGAATTGAAAAAATCAGACAGAGTACTTTTT CATATTCAAAGTATTTTTATCTGGATAGTATCTTTAGGAATACCAATTTTTCTTTTTGTAGGTGGATATA TAAAAAGAGATGTTTCTTTAAGCTATATATTAATTATTTTGACTATAATGATTCCTTTTTACTGCTGGTT GTATATAGCAAAAAATCATAAAGCCAAGATAAAAAATATTATATTGGGAAGTGGAATATTAATGCTCATA GCTAACAATTCTACAAATTGGTTTATAGAAAGAGAAATTAGAGAAAAAAATGATAAAAGTATTCCTAAAA TAAGCATGGCAAAGAAAATTCCAATTCAATGGGAAATATATTCTGATGATTTTGAAATAGAAGATGTGTG GAATATTGGAAAAAAGATAAATAAACTTGATGATAAAGTGTTGTTGAAAGATGAGTTTGTTATTTTGGAA AATGATGAATTAGATATGGAAAAGTTTAAAAATTACTTTATAGCAGATAAAAAAATATTTACTCGTGGAA ATAACGATATAGTAAAACTATTTTATCTGGAAAAATTGGAGGATATGAATGAAGATTTTGATAACAGGAG CAGCAGGATTTATAGGGTCGCATTTAACAGAGGAGCTGCTGAAATTAAAAAATAA

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