F. varium 27725_FusoPortal_Gene_2066

InterPro predicted function: Autotransporter beta-domain
InterPro Accessions: IPR005546

Link to full Interpro analysis


Previous Gene Next Gene

Return to complete Genome Map of F. varium 27725

FASTA file of all annotated F. varium 27725 genes - Amino Acids | FASTA file of all annotated F. varium 27725 genes - DNA

Additional Links

Hidden Markov Model (HMMScan) for domains: 27725_FusoPortal_Gene_2066.out

Amino Acids: 1272

ORF FASTA file - Amino Acids

MIEKIIKAVKSSNKRRGRNITIGVVIGFLLLCTVVMGAGDYLWIREKDNTIQFNTINTND ENGTNGNWNTANPYSDNNWDTVKKTYTNNMTLLSSEKNGVNTNGDNISYGLRLSGNLTGV NFVNNGSIIGTMSGNISSYGFGIYNTGTMGNIENVGLINGTGKSDDKGYGYGIYNSGTMG NIENKGTISGTGTDAGYGIYNSGTMGNIENKGTISGTGTDAGYGIYNSEKIGDITNTGVI SGFGASDYGKGYGIYNDSNEKKMGNITNKGIISVYSSGYSSGGYSSGYSYGIYNKSGTIG DITNTGIMSVSGNGTSSNSSIGNGYGIYNSSGTIEDITNTGIINVFGYSISNNSISNTGW NYGFGIYNKATIEDITNAGIISGTGYNNGLGYGIYNMGTMGNIANKGIISGSGNDLGYGI DNDSEDKGKVNIANVGVIYGKTNAIKKSNGTIAPSSNYGILVNGDGNNNKVIDGLDIVDG TPKENEILNKGLIFTAVDGGGYKAEEKEYGKFGQTFDKDAGTRIINAAASGNGKDNITGT ESLKLENGTLTYSDSNGEEQTETISSSKGYILNGITNTLEVSEGNNELNNSVINAYGTAV VFGDTGDKELTLSGTIVNGGIDESDSNPGTKVAAILGSDNGDTLILQFIVSNQGIQNTVV NGNINMGAGADTLTIGDGTIINGILDGGDSDSEDTLNFGVSSGAKSIPGESQGINIMHNI TNFENINVGENTNVTLFEKTIGADGKETALEVSGVKEIDIKAGGVLNLRIDSQKLNGGRY EGHALFNKNTSLIINGDISQLPDGKTEIKETEGEKYKVGVFNLITNGLGINAIIAMDGIT LKENLFVKTNSILDRATIIKSPSGNEQVGDIKIEDNEDIFVINKEIPRDEQKYIKLNEIY KGVHSSARENFNALKDILTLNAAGGDYTSVTDKEQLATLLSYLNNIYTRTPYSFSSELSR KSAGMFRDIVTENQFRPDMNKWLIMGGLTHRDGGTKDTYYGKNYHGFDTGTADVDVDMKL TGAYALGKYGYSENVSLGVTVGGNKSEAKLPMSKVKGNSGYVGTFAENYRGNLTLKAGAG IQYSEYDANRATLGGHSYSEKYSDMTYDIYLNGRYSHNIGNNLFLEPYGTLSYTYIKQDS ADEGSKVLAIETDSKSFDYTAAKVGVDIKKVIPNEKGKSTLSAGVSYTRLLTGADEENIT GRFKGGSDFDILVAHKNKHSIGLNAKYALELESGILFDVKGSYSFERDSHNESGKNRNKG EWIVGAGLGYKF

Coding DNA - Genome Coordinates: 2286525-2290343 | Orientation: Forward

ORF FASTA file - Coding DNA

ATGATTGAAAAGATTATAAAGGCAGTAAAGAGCAGCAACAAAAGAAGAGGAAGAAACATAACGATAGGGG TAGTGATTGGATTTTTGTTGTTGTGTACAGTAGTAATGGGGGCAGGTGATTATCTTTGGATAAGAGAAAA GGATAATACAATACAATTTAATACAATAAATACTAATGATGAAAATGGTACTAATGGAAATTGGAATACA GCAAATCCATATAGCGATAATAATTGGGATACAGTTAAAAAAACTTATACAAACAATATGACATTGTTAT CAAGTGAAAAAAATGGGGTAAATACTAATGGCGATAATATAAGTTATGGACTTAGATTAAGTGGTAACTT GACTGGAGTGAATTTTGTAAATAATGGTTCAATAATAGGAACAATGAGTGGTAACATTTCTAGTTATGGT TTTGGAATATATAATACAGGTACAATGGGAAATATAGAAAATGTAGGACTGATAAATGGTACTGGTAAAA GTGATGATAAAGGTTATGGTTATGGAATATATAATTCAGGTACAATGGGAAATATAGAAAATAAAGGAAC AATAAGTGGTACTGGTACTGATGCTGGTTATGGAATATATAATTCAGGTACAATGGGAAATATAGAAAAT AAAGGAACAATAAGTGGTACTGGTACTGATGCCGGTTATGGAATATATAATTCAGAAAAAATTGGAGATA TAACAAATACAGGAGTAATAAGTGGTTTTGGTGCTAGTGATTATGGTAAAGGTTATGGAATATATAATGA TAGTAATGAGAAAAAAATGGGAAATATAACAAATAAGGGAATAATAAGTGTTTATAGTTCTGGTTATAGC TCTGGTGGTTATAGCTCTGGTTATAGTTATGGAATATATAATAAATCAGGTACAATTGGAGATATAACAA ATACAGGGATAATGAGTGTTTCTGGCAATGGGACTAGTTCTAATTCTAGTATTGGTAATGGTTATGGAAT ATATAATAGTTCAGGTACAATTGAAGATATAACAAATACAGGAATAATAAATGTTTTTGGTTATAGTATT TCTAATAATAGTATTTCTAATACTGGTTGGAATTATGGTTTTGGAATATATAATAAAGCTACAATAGAAG ATATAACAAATGCAGGAATAATAAGTGGTACTGGTTATAATAATGGTTTGGGTTATGGAATATATAATAT GGGGACAATGGGAAATATAGCAAATAAAGGAATAATAAGTGGTTCTGGTAATGATTTGGGTTATGGAATA GATAATGATAGTGAGGATAAAGGAAAGGTAAATATAGCAAATGTAGGAGTTATTTATGGGAAAACTAATG CTATAAAGAAAAGTAATGGAACTATAGCTCCATCAAGTAATTATGGAATACTTGTAAATGGAGATGGTAA TAATAATAAGGTAATTGATGGATTAGATATTGTCGATGGAACTCCAAAAGAAAATGAAATATTAAATAAA GGTTTAATATTTACAGCAGTAGATGGAGGAGGATATAAAGCAGAAGAAAAAGAGTATGGAAAATTTGGAC AAACTTTTGATAAAGATGCAGGAACTAGAATAATCAATGCTGCAGCATCGGGAAATGGTAAAGATAATAT AACAGGAACTGAAAGTTTAAAATTAGAAAATGGAACTTTAACATATAGTGATTCAAATGGTGAAGAGCAA ACAGAAACTATTTCTTCAAGTAAAGGATATATATTAAACGGTATAACAAATACTTTGGAAGTTTCAGAAG GAAATAATGAACTTAATAATTCAGTAATTAATGCTTATGGAACAGCAGTTGTATTTGGAGATACAGGAGA TAAAGAGCTGACTTTATCAGGAACAATAGTAAATGGTGGAATAGATGAGAGTGATTCTAATCCTGGTACT AAAGTGGCAGCTATATTAGGAAGTGACAATGGAGATACTTTAATACTTCAGTTTATAGTTAGTAATCAAG GTATTCAAAATACTGTAGTCAATGGAAATATAAATATGGGAGCTGGAGCTGATACCCTTACAATTGGAGA TGGCACAATAATTAATGGAATTCTTGATGGTGGAGATAGCGATTCTGAAGATACTCTTAATTTTGGAGTA AGTTCAGGTGCTAAGTCAATTCCAGGTGAAAGTCAAGGAATAAATATTATGCACAATATAACTAATTTTG AAAATATAAATGTAGGAGAAAATACAAATGTCACTTTGTTTGAAAAAACTATTGGTGCAGATGGAAAAGA AACAGCTCTAGAAGTTTCAGGAGTGAAAGAGATAGATATAAAAGCAGGTGGAGTTCTTAATTTAAGAATA GACAGCCAGAAATTGAATGGTGGAAGATATGAAGGACATGCCTTATTTAATAAAAATACTAGTCTTATAA TCAATGGAGATATTAGTCAGTTGCCAGATGGGAAAACAGAAATTAAAGAAACAGAAGGTGAAAAATACAA GGTAGGAGTATTTAACCTTATAACAAATGGGCTAGGAATAAATGCCATAATTGCTATGGACGGAATAACT TTAAAAGAAAATCTTTTTGTTAAAACTAATTCCATATTGGATAGAGCTACGATTATAAAAAGTCCAAGTG GAAATGAGCAAGTAGGAGATATAAAGATTGAAGACAATGAAGATATTTTTGTAATAAACAAAGAAATACC AAGAGATGAGCAAAAATATATAAAATTAAATGAAATATATAAAGGAGTACATTCAAGTGCAAGGGAAAAT TTTAATGCATTAAAAGATATTTTAACTTTAAATGCAGCAGGAGGAGATTATACATCAGTAACAGATAAAG AACAGCTAGCTACACTTTTATCTTACTTAAATAATATCTATACAAGAACTCCATACTCATTTTCAAGTGA GCTTTCAAGAAAATCAGCTGGAATGTTTAGAGATATAGTGACAGAAAATCAATTTAGACCAGATATGAAT AAATGGTTGATAATGGGTGGACTAACTCATAGAGATGGAGGAACTAAAGATACATATTATGGAAAAAATT ATCATGGCTTTGATACAGGTACAGCTGATGTAGATGTGGATATGAAGCTTACTGGAGCTTACGCCCTGGG TAAATATGGATATTCAGAAAATGTATCATTAGGAGTAACAGTAGGAGGAAATAAAAGTGAAGCTAAACTT CCAATGTCAAAAGTAAAAGGAAACAGTGGATATGTAGGAACTTTTGCAGAAAACTACAGAGGAAACCTTA CACTGAAAGCTGGAGCAGGAATTCAATATTCTGAATATGATGCTAATAGAGCAACATTAGGAGGACACAG TTACAGTGAGAAATATTCAGATATGACATATGATATCTACCTAAATGGAAGATATTCTCATAATATTGGA AATAATTTATTCTTAGAGCCATATGGAACACTGTCATATACATATATCAAGCAGGATAGCGCAGATGAAG GAAGCAAGGTTCTTGCAATAGAAACAGATTCAAAATCATTTGACTATACAGCAGCTAAAGTGGGAGTAGA CATTAAGAAAGTAATACCAAATGAAAAAGGAAAGAGTACACTGTCAGCAGGAGTGAGCTATACAAGACTT CTTACTGGGGCAGATGAAGAAAACATCACAGGAAGATTTAAAGGTGGAAGCGACTTTGATATTTTGGTAG CTCATAAAAATAAACACAGTATAGGATTAAATGCTAAGTACGCACTTGAACTTGAAAGTGGAATTCTGTT TGATGTAAAAGGAAGCTATTCATTTGAAAGAGATTCACATAATGAAAGTGGAAAAAACAGAAACAAAGGT GAATGGATAGTAGGAGCAGGACTGGGGTATAAGTTCTAA

Previous Gene Next Gene